要區別水解工藝與厭氧工藝的概念，必須先了解厭氧工藝的反應經(jīng)路。
通常，我們把厭氧反應分為四個(gè)階段：第一階段水解；第二階段酸化；第三階段酸性衰退；第四階段甲烷化。
在水解階段，固體物質(zhì)溶解為溶解性物質(zhì)，大分子物質(zhì)降解為小分子物質(zhì)，難生物降解物質(zhì)轉化為易生物降解物質(zhì)。在酸化階段，有機物降解為各種有機酸。水解和產(chǎn)酸進(jìn)行得較快，難以把它們分開(kāi)。起作用的主要微生物是水解菌和產(chǎn)酸菌。
我們所說(shuō)的水解工藝，就是利用厭氧工藝的前兩段，即把反應控制在第二階段，不進(jìn)入第三階段。為區別厭氧工藝，定名為水解（Hydrolization）工藝。水解反應器中實(shí)際上完成水解和酸化兩個(gè)過(guò)程。但為了簡(jiǎn)化稱(chēng)呼，簡(jiǎn)稱(chēng)為“水解”。
水解工藝系統中的微生物主要是兼性微生物，它們在自然界中的數量較多，繁殖速度較快。而厭氧工藝系統中的產(chǎn)甲烷菌則是嚴格的專(zhuān)性厭氧菌，它們對于環(huán)境的變化，如PH值、堿度、重金屬離子、洗滌劑、氨、硫化物和溫度等的變化，比水解菌和產(chǎn)酸菌要敏感得多，并且生長(cháng)緩慢（世代期長(cháng)）。
最重要的是水解工藝和厭氧工藝中的兩類(lèi)不同菌種的生態(tài)條件差異很大。水解工藝是在缺氧條件下反應，而厭氧工藝則是在厭氧條件下反應。這里說(shuō)的“缺氧”（anoxic）有別于“厭氧”，所謂厭氧（annaerobic）作用是指絕對的無(wú)氧（溶解氧DO＝0），而缺氧（anoxic）作用是指無(wú)氧或微氧（DO＜0.3-0.5mg/l) 。
